Efficient calculation of steady state probability distribution for stochastic biochemical reaction network

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Communication: limitations of the stochastic quasi-steady-state approximation in open biochemical reaction networks.

It is commonly believed that, whenever timescale separation holds, the predictions of reduced chemical master equations obtained using the stochastic quasi-steady-state approximation are in very good agreement with the predictions of the full master equations. We use the linear noise approximation to obtain a simple formula for the relative error between the predictions of the two master equati...

متن کامل

Network translation and steady state properties of chemical reaction systems

Network translation has recently be used to establish steady state properties of mass action systems by corresponding the given system to a generalized one which is either dynamically or steady state equivalent. In this work we further use network translation to identify network structures which give rise to the well-studied property of absolute concentration robustness in the corresponding mas...

متن کامل

Steady state of Stochastic Sandpile

We study the steady state of the abelian sandpile models with stochastic toppling rules. The particle addition operators commute with each other, but in general these operators need not be diagonalizable. We use their abelian algebra to determine their eigenvalues, and the Jordan block structure. These are then used to determine the probability of different configurations in the steady state. W...

متن کامل

An equation-free probabilistic steady-state approximation: dynamic application to the stochastic simulation of biochemical reaction networks.

Stochastic chemical kinetics more accurately describes the dynamics of "small" chemical systems, such as biological cells. Many real systems contain dynamical stiffness, which causes the exact stochastic simulation algorithm or other kinetic Monte Carlo methods to spend the majority of their time executing frequently occurring reaction events. Previous methods have successfully applied a type o...

متن کامل

analysis of ruin probability for insurance companies using markov chain

در این پایان نامه نشان داده ایم که چگونه می توان مدل ریسک بیمه ای اسپیرر اندرسون را به کمک زنجیره های مارکوف تعریف کرد. سپس به کمک روش های آنالیز ماتریسی احتمال برشکستگی ، میزان مازاد در هنگام برشکستگی و میزان کسری بودجه در زمان وقوع برشکستگی را محاسبه کرده ایم. هدف ما در این پایان نامه بسیار محاسباتی و کاربردی تر از روش های است که در گذشته برای محاسبه این احتمال ارائه شده است. در ابتدا ما نشا...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: BMC Genomics

سال: 2012

ISSN: 1471-2164

DOI: 10.1186/1471-2164-13-s6-s10